中高一貫制の男子校。開成中学・高校や、神戸の灘中学・高校にならぶ国内最高クラスの難易度を誇る。
教育レベルは非常に高度で、中高生でありながら現役現役コンピュータ技術者として活躍する生徒も存在する。筑波大学の付属校ではあるが、筑波大学への特別な内申枠は有していない。
このほか、数学オリンピックへの参加や、母体となった駒場農学校以来の伝統である稲作実習などがある。

生徒の自主性を重んじた指導が行われているが、中高一貫校の特有の余裕ある授業時間を生かし、非常に高度な内容の指導が行われている。教科書だけではなく手作りのプリントなども使用される。